Nacionalni CERT nadležan je za cijelu hrvatsku domenu .hr, odnosno za sve davatelje internet usluga (ISP) u Republici Hrvatskoj i korisnike koji se ne nalaze carnet.hr domeni i koji nisu tijela državne vlasti.
CERT ZSIS nadležan je za državna tijela, tijela jedinica lokalne i područne (regionalne) samouprave, pravne osobe s javnim ovlastima te pravne i fizičke osobe koje u svom poslovanju ostvare pristup ili postupaju s klasificiranim i neklasificiranim podacima.