Sandboxie je alat koji omogućuje izvršavanje programa unutar izoliranog prostora (eng. sandbox) tvrdog diska, odnosno sprječava da on učini bilo kakvu promjenu unutar drugih programa i podataka na računalu. Time se osigurava mnogo veća razina sigurnosti i to, kako navodi proizvođač jer:

• zloćudni sadržaj eventualno preuzet preko web preglednika, ostaje izoliran, odnosno ne može naškoditi računalu korisnika te se lako može ukloniti
• posjećene web stranice, kolačići i ostali zaostali sadržaj web preglednika
• zloćudni sadržaj iz privitaka poruka elektroničke pošte ne može naškoditi računalu jer ostaje izoliran
• sumnjivi softver se može instalirati preko alata i time spriječiti eventualnu štetu ako je riječ o zloćudnom softveru

Dok je pokrenut, ikona od Sandboxie nalazi se u sistemskoj traci, te je od tamo moguće pokrenuti alat ili direktno pokrenuti program koji će se izvršavati izolirano (tzv. „sandbox“). Meni alata nam nudi u izbor izolirano pokretanje web preglednika, e-mail klijenta, preglednika datoteka (a to je Windows Explorer), bilo kojeg programa (izvršnu datoteku) sa tvrdog diska ili programa iz Start izbornika. U alatu vidimo listu tako pokrenutih programa koji se mogu smjestiti u različite „sandboxeve“, odnosno alat nam omogućuje stvaranje više izoliranih okolina. Inicijalno postoji jedna, imenom „DefaultBox“, a uobičajeno je da unutar okoline osim pokrenutih programa budu i procesi od samog alata. Naslov prozora od pokrenutog programa se nalazi dva znaka [#]. Datoteke koje nastaju iz pokrenutih programa preko Sandboxie alata (npr. preuzete preko web preglednika), alat ostavlja izolirane u „sandboxu“. Ako se datoteka sprema na nekom od uobičajenih mjesta (Desktop, My Documents) tada alat nudi automatsko izvlačenje te datoteke (Immediate Recovery), inače se treba poslužiti opcijom Quick Recovery. Pomoću opcije view iz glavne trake alata se može vidjeti popis svih datoteka prema „sandboxevima“. Postoji i opcija automatskog brisanja sadržaja (datoteka) „sandboxa“.